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潔淨室是指工作區具有一定的潔淨度級別要求的房間。潔淨室根活性碳濾網據工作區氣流的形式，分為垂直單向流潔淨室、水平平行流潔淨室和亂流潔淨室。根據控制對像分為：工業潔淨室和生物潔淨室。雖然潔淨室內的空氣具有一定的潔淨度，但是由於潔淨室內的人體、工藝設備與圍護結構被病原體微生物污染的機會很多，污染後也很難察覺，因此，在很多情況下，如預防性消毒、消毒處理等必須形成一種制度，要經常進行才能較好的防止傳染的發生。因此，在潔淨室中，要加強消毒滅菌措施。
在潔淨室的日常管理中，消毒工作要形成制度，持之以恆，要合理選擇消毒方法，認真操作，預防潔淨室環境的污染或潔淨室對大氣環境形成污染。消毒方法的選擇要綜合考慮潔淨室內的工作性質，可能產生的微生物種類和處理對像等因素。由於紫外線消毒在大空間內的消毒效果很難控制，有條件的潔淨室，應盡量選用熏蒸消毒，消毒時嚴格遵守消毒程序，同時也要考慮到消毒方法的負面影響，采取措施將其負面影響減到最小。
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